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短信通知车辆被扣3分，是否需要缴纳罚款取决于具体情况。
扣分的原因可能包括违章停车、违反交通信号灯等违章行为，对于这些违章行为，交管部门会根据相关法规进行处罚，并可能通过短信通知车主，这种情况下，扣分是需要缴纳罚款的，罚款的金额会根据违章行为的严重程度和当地交管部门的规定而定。
有时候短信可能是诈骗信息，收到短信后应首先确认短信的来源是否真实可靠，可以通过拨打当地交管部门的电话或者前往交管部门网站查询等方式进行核实，如果确定是诈骗短信，则不需要按照短信内容支付罚款。
收到短信通知车辆被扣分后，应先核实信息的真实性，了解扣分的原因和相应处罚规定，再确定是否需要缴纳罚款，如有疑问，建议及时咨询当地交管部门。